大便时屁眼痛可能由以下原因引起：
1.肛裂：肛管皮肤全层纵行裂开并形成感染性溃疡，是一种常见的肛管疾病。典型表现为肛门疼痛、便血和便秘。肛裂引起的疼痛多剧烈，有典型的周期性。排便时，粪便刺激溃疡面的神经末梢，引起肛门剧痛，便后数分钟疼痛缓解，随后因肛门括约肌收缩再次剧痛，此期称疼痛间歇期。以后因内括约肌痉挛，又产生剧痛，此期可持续半小时至数小时，临床称为肛裂疼痛周期。
2.外痔：外痔位于齿线以下，是由痔外静脉丛曲张或肛缘皱襞皮肤发炎、肥大、结缔组织增生或血栓瘀滞而形成的肿块。外痔表面盖以皮肤，可以看见或摸到，不能送入肛内，不易出血，以疼痛和有异物感为主要症状。
3.肛周脓肿：是指肛门周围软组织发生的急性化脓性感染，并形成脓肿。其主要症状是肛门周围持续性疼痛，逐渐加剧，伴有红肿和发热。
4.肛管或直肠损伤：肛管或直肠因外伤或手术而导致的损伤，也可能引起大便时屁眼痛。
5.肛门直肠神经官能症：如果排除了上述器质性疾病，则可能是肛门直肠神经官能症引起的疼痛。这类患者常常伴有肛门坠胀、不适、疼痛等症状，但检查时无明显阳性体征。
需要注意的是，以上只是一些可能的原因，具体情况需要根据患者的具体症状、体征和相关检查来确定。如果疼痛持续不缓解或伴有其他症状，建议及时就医，以便明确诊断并进行相应的治疗。