大便时肛门痛的原因及治疗方法如下：
1.肛裂：
病因：多由大便干结、排便用力过猛，导致肛管皮肤全层裂开。
原理：肛管皮肤裂伤后，形成梭形溃疡，排便时由于受到刺激，肛门疼痛剧烈。
治疗方法：
调整饮食：多吃蔬菜、水果，多饮水，使大便松软、通畅。
局部坐浴：便后用1:5000高锰酸钾溶液坐浴，可改善局部血液循环，缓解疼痛。
外用药物：肛裂局部涂抹硝酸甘油软膏，可缓解肛管括约肌痉挛，减轻疼痛。
扩肛疗法：适用于急性或慢性肛裂不并发乳头肥大及前哨痔者。
手术治疗：若肛裂反复发作，保守治疗无效，可考虑手术治疗。
2.外痔：
病因：肛缘皮肤皱襞突起，如水泡样，皮下有淤血，形成血肿，伴有剧痛。
原理：外痔位于齿线以下，由痔外静脉丛曲张或肛缘皱襞皮肤发炎、肥大、结缔组织增生或血栓瘀滞而形成的肿块。
治疗方法：
调整饮食：多吃蔬菜、水果，多饮水，保持大便通畅。
局部热敷：便后用1:5000高锰酸钾溶液坐浴，然后外用痔疮膏或栓剂。
手术治疗：若外痔较大，或经保守治疗无效，可考虑手术切除。
3.肛管或直肠炎：
病因：感染性炎症或非感染性炎症均可引起肛管或直肠疼痛。
原理：炎症刺激肛管或直肠黏膜，引起疼痛。
治疗方法：
针对病因治疗：如抗感染、抗炎症等。
局部用药：可使用痔疮膏、栓剂等药物。
调整饮食：多吃蔬菜、水果，多饮水，保持大便通畅。
其他治疗：如灌肠、坐浴等。
4.肛周脓肿：
病因：肛腺阻塞感染，形成脓肿。
原理：肛周脓肿多为肛周局部感染引起，感染可向肛管直肠周围间隙扩散，形成肛管直肠周围脓肿。
治疗方法：
手术治疗：切开引流或行根治术。
抗生素治疗：根据病情轻重，选择口服或静脉输注抗生素。
局部理疗：可缓解疼痛。
5.其他：
肛门癌：肛管或肛门周围的癌症也可引起肛门疼痛。
肛管直肠损伤：肛管或直肠受到外伤或医源性损伤，可引起疼痛。
肛门狭窄：肛门或肛管手术后，可因瘢痕挛缩而引起狭窄，导致排便困难和肛门疼痛。
总之，大便时肛门痛的原因较多，治疗方法也因病因而异。如果疼痛持续不缓解或伴有其他症状，应及时就医，明确诊断，以便进行针对性治疗。