怀孕50天流褐色分泌物可能与以下因素有关：
一、先兆流产：
1.原因：导致先兆流产的原因众多，和黄体酮水平、甲状腺激素水平等密切相关。
2.症状表现：患者除了有流褐色分泌物，还可能伴有下腹坠痛、胀痛等情况。
3.处理方式：建议患者尽快前往医院，根据医嘱使用黄体酮、丙硫氧嘧啶等药物来进行干预治疗。
二、子宫内膜脱落：
1.原因阐述：由于个体存在差异，部分女性怀孕后卵巢分泌的性激素，特别是孕激素水平相对较低，致使一小部分子宫内膜仍会持续脱落。
2.临床现象：在临床检查时就会发现患者流褐色分泌物。
三、宫外孕：
1.病症宫外孕指的是孕卵在子宫腔外着床发育的异常妊娠过程。
2.具体症状：宫外孕常有不规则阴道出血，颜色暗红、量少且淋漓不尽等状况，通常不会超过月经量，还可能会随阴道出血排出蜕膜管型或碎片，临床检查时可看到患者流褐色分泌物。
怀孕50天流褐色分泌物还可能存在其他原因，建议患者及时到医院，依据医嘱进行对症处理。