怀孕50天流褐色分泌物可能与以下因素有关：
一、先兆流产：
1.原因：导致先兆流产的原因众多，比如黄体酮水平异常、甲状腺激素水平异常等。
2.症状表现：患者除有流褐色分泌物外，还可能伴有下腹坠痛、胀痛等症状。
3.应对措施：建议患者即刻前往医院，遵医嘱使用如黄体酮、丙硫氧嘧啶等药物进行干预治疗。
二、子宫内膜脱落：
1.原因：由于个体存在差异，部分女性怀孕后卵巢分泌的性激素尤其是孕激素水平相对较低，致使一小部分子宫内膜仍继续脱落。
2.症状表现：临床检查会发现患者流褐色分泌物。
三、宫外孕：
1.原因：宫外孕指孕卵在子宫腔外着床发育的异常妊娠情况。
2.症状表现：常有不规则阴道出血，颜色暗红、量少且淋漓不尽，一般不超过月经量，还可随阴道出血排出蜕膜管型或碎片，临床可见患者流褐色分泌物。
怀孕50天流褐色分泌物还可能有其他原因，患者应及时前往医院，依据医嘱进行对症处理。
总结：怀孕50天出现流褐色分泌物的情况，可能由多种原因引起，包括先兆流产、子宫内膜脱落、宫外孕等，也可能存在其他因素，患者需尽快就医并接受专业诊治。