同房三天后查出怀孕，可能是以下原因引起的：
1.排卵期提前：女性的排卵期可能会因情绪、环境等因素而提前，即使在同房三天后，卵子仍有可能受精并着床，导致怀孕。
2.精子在体内存活时间长：精子在女性体内可能存活3-5天，甚至更长时间。如果在这段时间内正好遇到卵子，就有可能受孕。
3.验孕时间过早：虽然同房三天后查出怀孕的情况比较罕见，但有些女性可能在受孕后较早的时间就检测出怀孕。这可能是因为她们使用了敏感度较高的验孕工具，或者体内的激素水平变化较为明显。
4.多胎妊娠：极少数情况下，女性可能会同时受孕多个卵子，导致多胎妊娠。这种情况在同房三天后查出怀孕时也有可能出现。
需要注意的是，以上只是一些可能的原因，具体情况还需要进一步的检查和咨询医生。如果女性对怀孕的结果有疑问或担忧，应及时咨询医生，进行详细的咨询和检查。同时，在确认怀孕后，女性应注意保持良好的生活习惯，如均衡饮食、适量运动、避免吸烟和饮酒等，以保障胎儿的健康发育。