肛周脓肿与肛瘘在疾病情况、症状、治疗方法等方面存在区别。
一、疾病情况不同
肛周脓肿和肛瘘都属于肛周感染性疾病，其中肛周脓肿是肛周感染的急性期，而肛瘘大多属于感染的慢性期。并且，大部分肛瘘是由肛周脓肿引起的，比如肛周脓肿自溃或者在肛周脓肿手术切开引流后经过反复发作而形成瘘道，进而导致肛瘘。
二、症状不同
1.肛周脓肿：
浅表肛周脓肿主要表现为肛门周围持续性疼痛和肿胀，在坐立、行走或排便时疼痛会加重。
深部脓肿可能伴有会阴或腰骶部胀痛，脓肿较大时会出现发热、寒战、乏力等全身症状。肛腺炎、直肠黏膜下脓肿及括约肌间脓肿可能仅仅表现为肛门疼痛、排尿困难或里急后重。
2.肛瘘：
主要表现为肛瘘外口持续或间断流出少量脓性、血性、黏液性分泌物。
部分较大的高位肛瘘，因无括约肌限制，其瘘外口可有粪便、气体排出。
当瘘外口愈合，瘘管中脓肿形成且引流不畅时，患者会感到明显疼痛，同时可伴发全身感染症状，切开排脓后症状缓解。肛瘘最主要的临床特征是以上症状反复发作且难以自愈。
三、治疗方法不同
1.肛周脓肿：
若脓腔不明显，可以进行内科保守治疗，如抗感染治疗，常用药物有甲硝唑及氧氟沙星等，但需在医生指导下进行。
形成明确脓腔后，则需要手术治疗，常用手术方法有切开引流术、切开排脓术、肛周脓肿负压引流术等。
2.肛瘘：
基本上采取外科手术治疗，如瘘管切开术、肛瘘切除术等。
总之，肛周脓肿和肛瘘是有区别的，应根据具体情况进行准确诊断和合理治疗。