羊水穿刺不能检查智力发育情况，其主要目的是排除胎儿的染色体异常。
一、先天性智力低下的相关因素众多，包括染色体异常、颅内结构发育异常、宫内缺氧等。然而，并非所有的胎儿染色体异常都会导致智力低下，也并非所有智力低下都源于染色体异常。比如，21三体、18三体、13三体综合征等不仅会伴有多种发育畸形，还往往存在智力低下问题，但染色体检查只能检测出与染色体异常相关的智力发育低下情况。
二、羊水穿刺作为一种常用的产前诊断方式，存在一定局限性。所以，在整个孕期还需要通过定期进行超声检查来观测胎儿的发育状况。
总之，要全面了解胎儿的情况，需要综合运用多种检查手段。