治疗毛囊炎有效的药有多种，常见的外用药物如莫匹罗星软膏，一般局部涂抹能起到抗菌消炎的作用，帮助缓解毛囊炎症状。
外用抗生素类药物
莫匹罗星软膏： 这是一种常用的外用抗生素，对革兰阳性球菌有很强的抗菌活性，能有效抑制引起毛囊炎的细菌生长，适用于轻度的毛囊炎。一般直接涂抹在患处即可，使用方便。夫西地酸乳膏： 对引起毛囊炎的常见细菌，如金黄色葡萄球菌等有良好的抗菌效果。它可以通过抑制细菌蛋白质的合成来发挥抗菌作用，对于炎症明显的毛囊炎有一定的治疗作用，涂抹在清洁后的患处。
抗真菌类药物
酮康唑乳膏： 如果毛囊炎是由真菌感染引起的，比如马拉色菌感染导致的毛囊炎，酮康唑乳膏就比较适用。酮康唑能抑制真菌细胞膜麦角固醇的合成，影响真菌的代谢，从而起到抗真菌的作用。使用时取适量均匀涂抹在患病部位。联苯苄唑乳膏： 同样是抗真菌药物，对皮肤癣菌及念珠菌等有抗菌作用，可用于治疗真菌性毛囊炎。它通过干扰真菌细胞膜的合成来发挥抗真菌效应，涂抹后轻轻按摩至吸收。
中药类外用药
如意金黄散： 这是一种中药制剂，具有清热解毒、消肿止痛的功效。可以用醋或蜂蜜调成糊状后涂抹在毛囊炎患处，能缓解毛囊炎引起的红肿热痛等症状。龙珠软膏： 有清热解毒、消肿止痛、去腐生肌的作用，对于毛囊炎有一定的治疗效果，将其适量涂抹在患处即可，能帮助改善毛囊炎的症状，促进炎症消退。需要注意的是，不同类型的毛囊炎用药有所不同，在使用药物前最好先明确毛囊炎的病因，若是细菌感染还是真菌感染等。同时，对于一些特殊人群，如孕妇、儿童等使用这些药物时要谨慎，最好在医生的指导下使用，避免自行用药带来不良影响。