肠功能紊乱可以使用一些药物来缓解症状，比如调节肠道菌群的药物，像双歧杆菌四联活菌片，一般来说按疗程规范使用能较快改善肠道功能，但具体见效时间因人而异。
调节肠道菌群类药物
双歧杆菌四联活菌片： 它含有双歧杆菌、嗜酸乳杆菌等多种有益菌，能补充肠道有益菌群，调节肠道菌群平衡，改善肠功能紊乱引起的腹泻、便秘等症状。一般来说，连续服用几天到一周左右可能会有一定效果，但具体因个体肠道情况不同而有差异。地衣芽孢杆菌活菌胶囊： 可抑制有害菌生长，促进有益菌繁殖，调整肠道菌群失调，对肠功能紊乱导致的消化功能异常等有改善作用，通常服用后几天内可能会感觉到肠道功能有所改善。
缓解胃肠动力类药物
多潘立酮片： 能促进胃肠蠕动，加快胃的排空，缓解肠功能紊乱引起的腹胀、早饱等症状。通常在服用后15 - 30分钟可能开始发挥作用，半小时左右能感觉到胃肠蠕动有所增强，不适症状可能会减轻。莫沙必利片： 同样是促进胃肠动力的药物，作用机制与多潘立酮类似，但起效相对更快一些，大概服用后10 - 20分钟可能就开始促进胃肠蠕动，缓解相关不适。
抑制胃酸分泌类药物
奥美拉唑肠溶胶囊： 如果肠功能紊乱伴有胃酸分泌过多导致的反酸、烧心等情况，奥美拉唑可以抑制胃酸分泌。一般服用后1 - 2小时左右开始发挥抑制胃酸的作用，能有效缓解因胃酸过多引起的相关不适，从而间接改善肠功能紊乱伴随的症状。兰索拉唑肠溶片： 也是抑制胃酸分泌的药物，作用原理和奥美拉唑相似，服用后大约1 - 3小时开始抑制胃酸分泌，对于肠功能紊乱合并胃酸过多的患者，能帮助减轻胃酸对肠道的刺激，改善肠道功能状态。