13岁小孩发烧39度时，应尽快采取措施。首先要及时就医，然后在医生指导下进行相关治疗，包括服用退烧药、根据情况使用抗感染药物，同时配合物理降温。
一、退烧药：
1.当体温达到39摄氏度这种高烧状态时，仅依靠物理降温往往难以有效控制体温，此时需要在医生指导下使用如布洛芬、对乙酰氨基酚等退烧药来进行治疗。
2.这些药物可能存在一定不良反应，比如可能引起胃肠道反应等，所以务必严格按照医生规定的剂量服用。当体温降低到38摄氏度后，应依据医生的建议来决定是否停药。
3.在服药过程中一旦发生过敏反应，必须立即停药并更换其他合适的药物。
二、抗感染：
1.若经过血常规检查和CRP检查等，明确判断出发热类型为感染性发热，那就需要进行抗感染治疗。
2.如果是病毒感染，可以应用奥司他韦颗粒进行治疗；若是细菌感染，则要使用敏感抗生素，如阿莫西林胶囊、头孢拉定胶囊等药物来治疗。
三、物理降温：
1.可以使用冰袋或湿毛巾对头部、腋窝、大腿内侧等部位进行冷敷。
2.洗热水澡也是一种有效的降温方法。
总之，当13岁小孩出现39度高烧时，要通过多种方法综合处理，以尽快降低体温，缓解不适，同时要针对病因进行治疗，促进身体恢复健康。