宝宝腹泻发烧时，可根据具体情况选择合适药物。一般来说，可选用益生菌调节肠道菌群，如双歧杆菌等，能在一定程度上缓解腹泻，通常需遵医嘱使用。
退热药物选择
对乙酰氨基酚：适用于3个月以上的宝宝，它通过抑制前列腺素合成发挥退热作用，能有效降低体温，一般在体温超过38.5℃且宝宝有不适时可使用。布洛芬：适用于6个月以上的宝宝，同样是通过抑制前列腺素合成来退热，退热效果相对持久，也在宝宝体温达到38.5℃以上且有发热不适表现时考虑使用。但要注意，使用这些退热药物时需严格按照年龄和剂量要求，不能超量使用。
止泻药物选择
蒙脱石散：可以吸附肠道内的病原体和毒素，保护肠道黏膜，从而起到止泻作用。一般用温水冲服，不同年龄段宝宝服用剂量有区别，需遵医嘱。口服补液盐：当宝宝腹泻导致脱水时，口服补液盐能补充水分和电解质，预防和纠正脱水。要按照说明书正确配制和服用，小婴儿服用时需少量多次给予。
针对病因的药物
如果是细菌感染引起的腹泻发烧，可能需要使用抗生素，如头孢克肟等，但抗生素的使用必须严格由医生根据宝宝的病情、血常规等检查结果来决定，不能自行盲目使用。如果是病毒感染导致的，目前尚无特效抗病毒药物，主要还是以对症支持治疗为主，如上述的退热、止泻等处理。同时，要注意让宝宝多休息，保证充足的水分摄入，饮食上可暂时给予清淡、易消化的食物，如小米粥等，避免食用油腻、刺激性食物加重肠胃负担。