宝宝腹泻发烧时，可根据具体情况选择合适药物。一般来说，可使用益生菌调节肠道菌群，如双歧杆菌等，能在一定程度上缓解腹泻症状。
益生菌类药物
双歧杆菌： 属于肠道益生菌，能补充肠道有益菌，调节肠道微生态平衡，对因肠道菌群失调引起的腹泻可能有帮助。它通常比较安全，适合宝宝使用。枯草杆菌二联活菌颗粒： 含有枯草杆菌和屎肠球菌等有益菌，可改善肠道功能，对腹泻、便秘等肠道问题有一定调节作用，能辅助缓解宝宝腹泻发烧时的肠道不适。
退热药物
对乙酰氨基酚： 如果宝宝体温超过38.5℃，可以考虑使用对乙酰氨基酚来退热。它是儿科常用的退热药物之一，通过抑制前列腺素合成发挥退热作用，一般能在较短时间内降低体温，但要注意按照宝宝体重等正确使用剂量。布洛芬： 也是常用的退热药物，适用于6个月以上宝宝，退热效果相对持久。它同样是通过抑制炎症介质发挥退热作用，当宝宝发热且体温达到使用指征时可选用，但要注意宝宝的年龄等适用情况。
止泻药物
蒙脱石散： 具有吸附肠道内病原体和毒素的作用，能保护肠道黏膜，从而起到止泻的效果。服用时需注意用适量温水冲服，且要与其他药物间隔一定时间服用，避免影响其他药物吸收。不过，对于宝宝腹泻，应先明确病因，若腹泻严重或持续不缓解，需在医生指导下合理使用。鞣酸蛋白酵母散： 由鞣酸蛋白和干酵母组成，鞣酸蛋白能使肠黏膜表层蛋白凝固，形成保护膜，减少刺激；干酵母可促进消化，常用于小儿消化不良性腹泻，对宝宝腹泻有一定缓解作用，但也需在医生指导下根据宝宝具体情况使用。需要注意的是，宝宝出现腹泻发烧情况时，首先要及时就医明确病因，在医生指导下谨慎用药。同时，要多给宝宝补充水分，防止脱水，密切观察宝宝的精神状态、体温变化等情况，若病情无改善或加重，应及时复诊。而且不同年龄段宝宝用药有不同要求，一定要严格遵循医生的建议，不能自行随意给宝宝用药。