肌肉酸痛可能由多种原因引起。一般来说，运动后肌肉酸痛较为常见，比如突然进行大量运动，像连续跳绳30分钟以上，就可能导致肌肉产生乳酸堆积，引发酸痛，这种情况通常在运动后1 - 2天内较为明显。
运动相关原因
过度运动引发： 当进行超出身体适应范围的运动时，肌肉会受到微小损伤，同时代谢产生乳酸等物质堆积。例如长跑爱好者一次跑量突然从5公里增加到10公里，腿部肌肉就很容易出现酸痛。另外，运动姿势不正确也会导致肌肉酸痛，比如俯卧撑时手部支撑位置不当，会使胸肌、手臂肌肉受力不均，进而引起酸痛。长期不运动后运动： 长期缺乏运动的人，突然进行运动，肌肉会不适应。比如长期久坐的人，突然开始打篮球，一般在运动后的第二天，全身肌肉尤其是腿部、腰部肌肉会明显酸痛，这种酸痛可能会持续2 - 3天。
疾病因素导致
感染性疾病： 流感等病毒感染性疾病可能伴随肌肉酸痛症状。感染流感病毒后，身体会出现炎症反应，累及肌肉时就会引发酸痛，同时还会伴有发热、咳嗽等症状。另外，一些细菌感染引起的疾病也可能导致肌肉酸痛，如链球菌感染引发的风湿热，除了关节疼痛外，也常出现肌肉酸痛的情况。自身免疫性疾病： 像类风湿关节炎，会累及肌肉，导致肌肉酸痛，同时伴有关节的肿胀、僵硬，尤其在早晨起床时症状较为明显，且症状会随病情变化而波动。还有系统性红斑狼疮，也可能出现肌肉酸痛的表现，同时伴有面部红斑、口腔溃疡等其他系统症状。
药物副作用
某些降脂药： 部分他汀类降脂药可能会引起肌肉酸痛的副作用。大约有1% - 2%的患者在服用他汀类药物后会出现不同程度的肌肉酸痛，一般在用药后的几周至数月内出现，表现为肌肉疼痛、乏力等。如果出现这种情况，需要及时告知医生，医生可能会调整用药方案。抗抑郁药： 某些抗抑郁药物也可能导致肌肉酸痛，比如选择性5 - 羟色胺再摄取抑制剂类药物，在用药过程中可能会出现肌肉紧张、酸痛等不良反应，具体的发生比例因药物种类和个体差异有所不同。