怀孕三个月后肚皮痒，主要与以下因素有关：
一、妊娠期痒疹：这是由于孕期体内激素水平发生变化，自身免疫功能也和孕前不同，导致孕妇皮肤变得敏感，从而可能出现妊娠期痒疹。对此，孕妇切不可擅自用药，一定要在医生的指导下进行对症治疗。
二、妊娠期糖尿病：孕期若血糖升高，会刺激末梢神经，这样孕妇就可能出现肚皮痒的情况，此时应及时就医，以控制体内血糖水平。
三、体癣：孕妇在这个时候如果不注重个人卫生，导致肚皮感染了真菌，就可能出现体癣，会有较为严重的肚皮瘙痒，同时还可能伴有红肿、疼痛、脱屑等症状。这种情况下，应在医生指导下使用一些抗真菌药物。
四、过敏性荨麻疹：若孕妇接触了过敏源，比如海鲜、牛羊肉、粉尘、花粉等，都会引发过敏荨麻疹现象，其主要症状之一便是皮肤出现瘙痒。
总之，怀孕三个月后肚皮痒可能是多种原因导致的，孕妇需注意观察自身状况，如有异常应及时就医，在医生的专业指导下进行相应的处理，切不可自行随意处理，以免对自身和胎儿造成不良影响。