龟头疼且龟头后部隐隐作痛可能由多种原因引起，比如包皮龟头炎，这种情况在男性中较为常见。一般来说，引起这种症状的原因不同，处理方式也不一样。
可能的原因及相关情况
包皮龟头炎导致的情况
感染因素： 细菌、真菌等感染都可能引发包皮龟头炎。例如大肠杆菌感染，就可能让龟头出现疼痛不适。如果是真菌感染引起的，往往还会伴有局部皮肤的红斑、瘙痒等表现。非感染因素： 过度手淫、局部创伤等也可能导致龟头后部隐隐作痛。比如手淫时用力不当造成局部损伤，就可能出现这种疼痛症状。
尿道炎累及的情况
淋菌性尿道炎： 由淋病奈瑟菌感染引起，除了尿道的症状，如尿频、尿急、尿痛外，也可能蔓延影响到龟头，导致龟头后部隐隐作痛。一般发病较急，有明确的不洁性生活史可能会增加患病风险。非淋菌性尿道炎： 多由衣原体、支原体感染所致，也可能出现龟头部位的不适，疼痛相对较轻微，但也会影响生活。
性传播疾病相关情况
梅毒： 一期梅毒可能会在阴茎部位出现硬下疳，当累及龟头时，也可能引起疼痛不适。硬下疳一般是单个无痛性的溃疡，边界清晰。尖锐湿疣： 由人乳头瘤病毒感染引起，病变部位可能出现在龟头、包皮等部位，也可能导致局部的不适感觉，包括隐隐作痛等情况，局部还会有疣体生长。如果出现龟头疼龟头后部隐隐作痛的情况，建议及时就医检查。医生一般会通过体格检查、分泌物涂片或培养等方式明确病因。如果是感染引起的，会根据具体的病原体进行相应的抗感染等治疗；如果是其他原因导致的，也会采取针对性的处理措施。同时，要注意保持局部的清洁卫生，避免刺激局部，患病期间避免性生活等。