头皮毛囊炎通常可以使用抗生素类药物来治疗，比如外用的莫匹罗星软膏，一般每天涂抹2-3次，能起到杀菌消炎的作用。
外用抗生素类药物
莫匹罗星软膏： 这是一种常用的外用抗生素，对多种革兰阳性球菌有抗菌活性，适用于细菌感染引起的头皮毛囊炎，直接涂抹在患处即可，能抑制细菌生长。夫西地酸乳膏： 对引起毛囊炎的常见细菌，如金黄色葡萄球菌等有较好的抗菌效果，每天涂抹2-3次，可缓解头皮毛囊炎的红肿、疼痛等症状。
口服抗生素类药物
头孢类抗生素： 若头皮毛囊炎比较严重，可能需要口服头孢类抗生素，如头孢拉定等。但使用前需要确认患者不对头孢类药物过敏，一般成人每天服用几次，具体剂量遵医嘱。不过儿童使用头孢类药物需要谨慎，要根据体重等因素调整剂量。大环内酯类抗生素： 像红霉素、阿奇霉素等也可用于头皮毛囊炎的治疗。阿奇霉素一般是每天服用一次，连续服用几天，但同样要注意药物的不良反应，比如胃肠道不适等，而且孕妇、哺乳期女性等特殊人群使用时需要咨询医生。
抗真菌类药物
外用抗真菌药： 如果头皮毛囊炎是由真菌感染引起的，可使用外用抗真菌药物，如酮康唑洗剂，每周使用2-3次，洗头时让洗剂在头皮上停留几分钟再冲洗，能抑制真菌生长。口服抗真菌药： 对于严重的真菌性头皮毛囊炎，可能需要口服抗真菌药物，如伊曲康唑等。但口服抗真菌药有一定的肝毒性风险，使用前需要检查肝功能，并且要严格遵医嘱用药，不能自行随意服用。