毛囊炎头皮可以使用抗生素类药物等治疗，一般局部外用药物较为常见。比如莫匹罗星软膏，它对革兰阳性球菌有很好的抗菌活性，能有效抑制毛囊处细菌感染。
局部外用药物选择
莫匹罗星软膏： 属于外用抗生素，适用于革兰阳性球菌引起的头皮毛囊炎。它能阻碍细菌合成蛋白质，从而发挥抗菌作用。一般直接涂抹在头皮患处，一天涂抹2 - 3次。夫西地酸乳膏： 对引起毛囊炎的金黄色葡萄球菌有良好的抗菌效果。可抑制细菌的蛋白质合成，局部涂抹于头皮毛囊炎部位，能减轻炎症、消除感染。
针对真菌感染的药物
酮康唑洗剂： 如果头皮毛囊炎是由真菌感染引起，酮康唑洗剂就比较适用。它可以抑制真菌细胞膜麦角固醇的合成，影响真菌代谢。使用时取适量洗剂涂于头皮，轻轻按摩几分钟后冲洗干净，每周使用2 - 3次。克霉唑软膏： 对多种真菌有抗菌作用，通过抑制真菌细胞色素P450酶系统，影响真菌细胞膜的合成。外用涂抹在头皮毛囊炎患处，一天2 - 3次。
注意事项
使用外用药物时要注意保持头皮清洁，用药前先将头皮清洗干净，这样更有利于药物吸收。如果头皮毛囊炎症状比较严重，或者外用药物效果不佳时，可能需要结合口服药物治疗，但口服药物需要在医生指导下使用，因为口服药物有一定的副作用和禁忌证。例如口服抗生素类药物可能会引起胃肠道不适等反应，所以不能自行随意服用。同时，要避免用手搔抓头皮，防止感染扩散。如果是儿童患有头皮毛囊炎，使用药物时要格外谨慎，应在医生的指导下选择合适的药物及用法用量，因为儿童皮肤较为娇嫩，对药物的耐受和反应与成人不同。