功能性消化不良常见的症状有上腹痛、上腹胀等。据统计，约有半数以上的功能性消化不良患者会出现上腹痛的症状。
上腹部疼痛相关症状
疼痛特点： 疼痛程度不一，没有明显的规律性，可能在进食后加重或缓解。有的患者表现为隐痛，有的则是胀痛。一般来说，这种疼痛不会向其他部位放射，但会持续或反复发作。伴随表现： 部分患者在腹痛的同时可能会伴有恶心的感觉，不过通常不会出现呕吐的情况，除非病情比较严重时才可能有少量呕吐。
上腹部饱胀相关症状
饱胀表现： 患者会感觉上腹部胀满不适，尤其是在进食少量食物后就会有明显的饱胀感，好像肚子里有很多气体排不出去一样。这种饱胀感可能会持续较长时间，从数小时到一整天不等。与进食关系： 进食是导致饱胀加重的一个重要因素，即使吃很少的东西，饱胀感也会比较明显，而且患者可能会因为担心进食后饱胀加重而减少进食量。
早饱相关症状
早饱定义： 是指患者进食后不久就有饱腹感，导致摄入食物量明显减少。例如，正常情况下能吃一碗饭的人，患功能性消化不良后可能吃半碗就感觉已经吃饱了，无法再继续进食。对饮食影响： 早饱会严重影响患者的营养摄入，长期下去可能会导致患者出现营养不良的情况，需要引起重视，及时进行调理。
其他相关症状
嗳气： 患者会不自觉地频繁嗳气，感觉有气体从胃里向上涌出，通过口腔排出。嗳气后有时会感觉上腹部的不适稍有缓解，但很快又会出现。食欲不振： 患者的食欲明显下降，对食物缺乏兴趣，即使面对平时喜欢的食物也没有想吃的欲望，这也是功能性消化不良常见的症状之一，会进一步影响患者的营养状况和生活质量。