羊水穿刺和无创DNA都是产前筛查染色体异常的方法，但适用情况不同。一般来说，无创DNA的价格大概在500~2000元左右，羊水穿刺费用通常在1000~2000元上下，但具体会因地区、医院等有所差异，总体而言无创DNA相对便宜些。
检测原理方面
无创DN
A： 是采取孕妇外周血，利用测序技术对胎儿游离DNA进行检测，从而分析胎儿染色体是否存在异常，比如常见的21 - 三体、18 - 三体、13 - 三体综合征等。羊水穿刺： 是在超声引导下，通过穿刺针获取羊水样本，直接分析羊水中胎儿细胞的染色体核型，能准确诊断胎儿是否患有染色体数目和结构异常疾病，像特纳综合征、唐氏综合征等都能明确诊断。
适用人群差异
无创DNA适用人群： 唐筛结果为临界风险的孕妇；年龄在35岁以上但不愿选择有创产前诊断的孕妇；孕妇血清学筛查显示胎儿常见染色体非整倍体风险值处于高风险切割值之外的情况；错过唐筛时间但又需要评估的孕妇。不过，孕妇有染色体异常胎儿分娩史、双胎妊娠等特殊情况时，可能不适合单纯做无创DNA。羊水穿刺适用人群： 年龄≥35岁的高龄孕妇；曾经生育过染色体异常患儿的孕妇；夫妇一方存在染色体结构异常的孕妇；超声检查发现胎儿结构异常的孕妇；唐筛高风险的孕妇。但如果孕妇有先兆流产症状、胎盘位置异常、羊水过少等情况，可能不适合做羊水穿刺。
检测准确性不同
无创DNA准确性： 对于常见染色体非整倍体的检出率能达到90%以上，但它属于筛查手段，存在一定假阳性和假阴性率。比如可能会出现检测结果提示低风险，但实际上胎儿有染色体异常的情况，或者检测结果提示高风险，实际胎儿是正常的。羊水穿刺准确性： 是诊断性的检查，准确性高达99%以上，能直接明确胎儿是否存在染色体异常，不过它是有创检查，有一定的流产风险，大概在0.5%~1%左右。