感冒反复发烧的原因主要有两方面，一是病原体未完全清除，二是出现肺部感染等并发症。
一、病原体未完全清除：发烧通常是由细菌或病毒等病原体感染引发。这些病原体释放毒素或细胞因子，会促使皮肤血管扩张，使局部汗腺分泌汗液导致皮肤潮湿，通过汗液蒸发可让机体出现散热反应，当产热反应小于散热反应时，体温会逐渐下降，病人的不适症状随之缓解，但这并不意味着体内病原体已被完全清除。由于病原体依然存在于体内且未被彻底消灭，其释放的毒素仍会刺激体温调节中枢，使调定点上移，从而导致机体产热反应大于散热反应，于是病人又会出现发烧症状。
二、出现肺部感染等并发症：感冒多为上呼吸道感染，当机体免疫力低下时，病原体大量繁殖，可进一步向下呼吸道蔓延，从而引起肺部感染，这种情况下就会出现反复发烧的现象，在治疗时需要加强抗感染的力度和延长治疗时间。
总之，感冒反复发烧主要是因为病原体未清除干净或引发了肺部感染等并发症，对此应根据具体情况采取针对性的治疗措施。