念珠菌感染的治疗通常根据感染部位和严重程度来选择药物，一般可以使用抗真菌药物进行治疗，比如制霉菌素等。对于皮肤念珠菌感染，可局部使用制霉菌素软膏等；而对于较为严重的念珠菌感染，可能需要口服氟康唑等药物。
不同部位念珠菌感染的治疗差异
皮肤念珠菌感染：
局部轻度感染： 若只是皮肤表面的轻度念珠菌感染，像腹股沟等部位出现的皮疹，可使用3%的碳酸氢钠溶液清洗局部，然后涂抹克霉唑乳膏，一般坚持用药数天可能会有改善。局部较顽固感染： 对于一些顽固的皮肤念珠菌感染，除了局部用药，还可以考虑配合口服氟康唑，但需要在医生评估后使用。
口腔念珠菌感染：
婴幼儿口腔念珠菌病： 婴儿出现鹅口疮，也就是口腔念珠菌感染时，可用2%的碳酸氢钠溶液清洁口腔，然后局部涂抹制霉菌素混悬液，通常经过1 - 2周的治疗大多能好转。成年人轻度口腔念珠菌感染： 成年人如果是轻度的口腔念珠菌感染，也可以使用氯己定含漱液漱口，同时配合局部使用制霉菌素含片，一般数天能看到效果。
阴道念珠菌感染：
单纯性阴道念珠菌病： 对于单纯性的阴道念珠菌感染，可选用局部用药，比如克霉唑栓，每晚1粒，连用7天；或者咪康唑栓，每晚1粒，连用3天等。复杂性阴道念珠菌病： 复杂性阴道念珠菌病可能需要延长治疗时间，或者增加药物剂量，比如口服氟康唑，不过需要在医生的指导下根据具体情况使用。
特殊人群的念珠菌治疗注意事项
孕妇念珠菌感染：
孕妇出现念珠菌感染时，局部治疗是主要的方式，尽量避免使用口服抗真菌药物。一般会选择对胎儿影响较小的药物，像克霉唑栓局部用药，因为口服药物可能会对胎儿发育产生潜在风险，所以要在医生的严格评估下进行治疗。
糖尿病患者念珠菌感染：
糖尿病患者容易反复发生念珠菌感染，因为高血糖环境利于念珠菌生长。这类患者在治疗念珠菌感染的同时，要积极控制血糖，只有血糖得到良好控制，念珠菌感染才不容易复发。比如将血糖控制在空腹血糖7mmol/L以下，餐后血糖10mmol/L以下等目标范围，同时按照念珠菌感染的治疗方案进行规范治疗。