肚子里面有时候疼有时候不疼可能由多种原因引起。比如胃肠道功能紊乱时，约有30% - 40%的人会出现这种间歇性腹痛的情况。
可能的胃肠道原因
饮食因素导致： 如果短时间内吃了过多辛辣刺激的食物，像大量吃辣椒、生蒜等，就可能刺激胃肠道，引起间歇性腹痛。比如一次性吃了超过50克的辣椒，就可能让胃肠敏感人群出现肚子时而疼时而不疼的情况。而如果吃了变质的食物，比如被细菌污染的剩饭剩菜，其中的细菌及其毒素会影响胃肠正常功能，也会导致肚子间歇性疼痛。胃肠蠕动异常： 胃肠蠕动过快或过慢都可能引发这种情况。比如功能性消化不良的患者，胃肠蠕动不协调，就会出现肚子有时候疼有时候不疼的现象，这类人群占消化不良患者的50%左右。另外，肠易激综合征患者，其肠道对刺激的敏感性增高，容易出现胃肠蠕动紊乱，进而导致间歇性腹痛。
其他系统疾病的影响
胆道系统问题： 胆囊结石就是常见原因之一。当结石移动时，会刺激胆囊壁或胆管，引起右上腹间歇性疼痛，疼痛可能会放射到肩背部，有时候疼有时候不疼。而胆道蛔虫症也会导致这种情况，蛔虫在胆道内窜动时，会引起腹部剧烈的阵发性绞痛，但有时候又会缓解，表现为肚子时而疼时而不疼。泌尿系统疾病： 输尿管结石也可能导致肚子间歇性疼痛。结石在输尿管内移动，会刺激输尿管平滑肌，引起腰部或下腹部间歇性绞痛，疼痛程度时轻时重，所以会出现肚子有时候疼有时候不疼的情况。比如直径在0.5 - 1厘米的输尿管结石，就比较容易引起这种间歇性的疼痛症状。
腹部脏器炎症相关
阑尾炎： 在阑尾炎早期，炎症刺激可能不严重，表现为脐周或者上腹部间歇性疼痛，随着病情发展，疼痛会转移并固定在右下腹。一般来说，约70% - 80%的阑尾炎患者会有转移性右下腹痛的典型表现，但早期也可能是肚子时而疼时而不疼。盆腔炎： 女性盆腔炎时，炎症刺激盆腔组织，也会出现下腹部间歇性疼痛，尤其是在劳累、性生活后可能会加重疼痛，而有时候又会相对缓解，导致肚子时而疼时而不疼。