三个月宝宝偶尔咳嗽可能由以下原因引起：
1.呼吸道感染：三个月宝宝的呼吸道比较娇嫩，容易受到感染。如果宝宝咳嗽伴有流涕、鼻塞、发热等症状，可能是呼吸道感染引起的。
2.过敏：宝宝对某些物质过敏，如尘螨、花粉、动物毛发等，也可能引起咳嗽。
3.干燥空气：空气干燥可能刺激宝宝的呼吸道，导致咳嗽。
4.胃食管反流：宝宝的胃容量较小，容易发生胃食管反流，胃酸反流到喉部可能引起咳嗽。
5.剧烈运动：宝宝剧烈运动后，可能会因为呼吸急促而咳嗽。
6.刺激性物质：宝宝吸入烟雾、化学物质等刺激性物质，也可能引起咳嗽。
7.其他：百日咳、先天性心脏病等疾病也可能导致宝宝偶尔咳嗽。
如果宝宝咳嗽不频繁，没有其他不适症状，可以先观察一段时间。保持室内空气湿润，适当给宝宝喂水。如果咳嗽加重、出现发热、呼吸急促等症状，应及时就医。医生可能会进行详细的检查，如听诊、血常规等，以确定咳嗽的原因，并给予相应的治疗。
需要注意的是，宝宝的咳嗽可能是一些严重疾病的早期表现，如肺炎、毛细支气管炎等。因此，如果家长对宝宝的咳嗽情况感到担忧，或者咳嗽持续时间较长，最好咨询医生的意见。医生会根据宝宝的具体情况，提供个性化的建议和治疗方案。同时，家长应该密切观察宝宝的病情变化，如有异常应及时就医。