面肌痉挛主要是由于面神经受到血管压迫引起的，据统计，约80% - 90%的面肌痉挛是因为颅内的小动脉与面神经根部发生接触，血管搏动刺激面神经导致异常放电，从而引发面部肌肉不自主抽搐。
血管压迫因素
动脉压迫情况： 常见的是小脑上动脉及其分支压迫面神经。这些动脉随着年龄增长可能会发生硬化，弹性变差，就更容易与面神经接触并产生压迫。比如随着人到中年后，动脉粥样硬化的发生率增加，面肌痉挛的发病风险也会相应提高。静脉压迫情况： 静脉血管压迫面神经也可能引发面肌痉挛，不过相对动脉压迫来说比例稍低一些。静脉压迫同样会导致面神经受到刺激，使得神经传导异常，进而引起面部肌肉的痉挛性收缩。
面神经本身病变因素
面神经炎症后改变： 当面神经曾经发生过轻度的炎症，比如病毒感染引起的面神经炎，在恢复过程中可能会出现神经纤维的脱髓鞘改变。脱髓鞘会使面神经的电传导变得不稳定，容易出现异常放电，从而导致面肌痉挛。一般病毒感染后的1 - 3个月左右，有可能出现面肌痉挛的症状。面神经损伤因素： 面部受到外伤等导致面神经损伤，在修复过程中也可能出现异常的神经冲动传导，引发面肌痉挛。比如面部受到撞击伤后，虽然当时可能没有严重的面瘫表现，但后续有可能逐渐出现面肌痉挛的症状。
遗传因素相关情况
家族性面肌痉挛： 有一定的遗传倾向，部分家族中可能存在多个成员患有面肌痉挛的情况。研究发现某些基因的突变可能与家族性面肌痉挛的发病相关，但具体的遗传模式还在进一步研究中。如果家族中有面肌痉挛患者，那么其他家族成员患面肌痉挛的风险会比一般人群略高一些，但并不是绝对会发病。