半月板微创手术后可能出现一些后遗症，比如约10% - 20%的患者会出现膝关节疼痛，尤其是在上下楼梯、蹲起等动作时更明显。
膝关节僵硬
术后早期未充分活动： 如果患者在半月板微创手术后，没有按照医生要求及时进行康复锻炼，膝关节可能会在术后1 - 2周内出现不同程度的僵硬。一般来说，正常的膝关节活动范围是屈曲0° - 135°左右，僵硬的患者可能屈曲角度会明显减小，比如只能达到90°左右，影响日常的行走、上下楼梯等活动。康复锻炼方法不当： 若康复锻炼的强度、频率不合适，也会导致膝关节僵硬。例如锻炼时过度用力或者锻炼不足，都不利于膝关节活动度的恢复。
肌肉萎缩
废用性肌肉萎缩： 半月板微创手术后，患者因为膝关节疼痛等原因，活动量减少，下肢肌肉会出现废用性萎缩。通常术后1个月左右，就能观察到大腿肌肉（股四头肌等）有萎缩迹象，表现为大腿围度较术前减小，比如术前大腿围度50cm，术后1个月可能变为48cm左右。神经因素相关萎缩： 虽然半月板手术一般不会直接损伤神经，但术后长期的疼痛等不适可能会影响神经对肌肉的支配，间接导致肌肉萎缩，但这种情况相对较少见。
半月板再次损伤
运动不当引发： 患者在术后3 - 6个月内，如果过早进行剧烈运动，像打篮球、快跑等，就有可能导致半月板再次损伤。比如一位30岁的男性患者，术后2个月就去打篮球，结果很快出现膝关节疼痛、肿胀，经检查发现半月板再次损伤。膝关节慢性劳损： 即使是术后较长时间，长期的膝关节慢性劳损也可能使半月板再次受损。例如一些重体力劳动者，术后膝关节长期承受较大压力，也有一定概率出现半月板再次损伤的情况。
创伤性关节炎
关节软骨磨损加重： 半月板微创手术后，如果膝关节的力学平衡没有完全恢复，关节软骨会受到异常的应力，导致软骨磨损加重。一般在术后1 - 2年左右，可能会出现创伤性关节炎的早期表现，如膝关节在活动时出现摩擦感，X线检查可见关节软骨下骨硬化等。炎症反应持续： 手术创伤可能会引起关节内持续的炎症反应，长期的炎症刺激会促进创伤性关节炎的发生发展。如果炎症不能有效控制，关节疼痛、肿胀等症状会逐渐加重，影响患者的生活质量。