孕早期上厕所有褐色分泌物，可能是以下原因引起：
1.先兆流产：孕早期胚胎着床不稳固，过度劳累、性生活、孕酮水平低等因素可能导致先兆流产，出现阴道少量流血，常为暗红色或血性白带。除了褐色分泌物，还可能伴有下腹部疼痛。此时需要及时就医，医生一般会建议进行超声检查、孕酮和人绒毛膜促性腺激素（hCG）检测等，以确定胚胎发育情况。如果确诊为先兆流产，需要卧床休息，必要时进行保胎治疗，如口服孕激素或注射黄体酮等。
2.异位妊娠：受精卵在子宫体腔以外的部位着床发育，称为异位妊娠，以输卵管妊娠最常见。异位妊娠时，随着孕囊的生长，会导致输卵管破裂，引起腹腔内出血，甚至危及生命。宫外孕发生后，也可能出现阴道少量流血，颜色可为褐色。同时，可能伴有下腹疼痛，严重时疼痛剧烈。如果怀疑异位妊娠，需要尽快就医，通过超声检查、血β-hCG测定等明确诊断。一旦确诊，应根据病情选择药物治疗或手术治疗。
3.宫颈息肉：宫颈息肉是宫颈管黏膜局部增生形成的赘生物，质地脆弱，容易因触碰而出血，表现为性生活或妇科检查后阴道少量流血。息肉通常为红色或鲜红色，与褐色分泌物有所不同。如果息肉较小，没有其他症状，通常不需要治疗；如果息肉较大或引起反复出血，可能需要进行手术切除。
4.其他：除了上述原因，阴道炎、宫颈炎、胎盘前置状态等也可能导致孕早期上厕所有褐色分泌物。
需要注意的是，孕早期出现褐色分泌物时，无论出血量多少，都应及时就医，进行相关检查，以明确原因，并采取相应的措施。同时，孕妇应注意休息，避免剧烈运动和性生活，保持心情愉悦，按照医生的建议进行产前检查。如果褐色分泌物持续不消失或伴有其他不适症状，如腹痛、阴道大量流血等，应立即就医。