益生菌一般情况下若食用正确，通常无副作用，但极少数患者可能会有皮疹、腹胀、腹泻等情况。且若无用药适应症，不建议长期服用益生菌。当肠功能屏障受损时，应用益生菌可能引发菌血症等状况。
一、益生菌不可以长期服用的原因：
益生菌不可长期吃。主要是因为益生菌主要作用是改善肠道菌群，辅助消化吸收，而每个人的肠道菌群各不相同。长期服用会产生依赖，反而致使自身免疫力下降，易引发其他疾病感染，还容易导致消化吸收功能出现障碍。
二、益生菌简介：
很多益生菌是人体肠道内正常的微生物，尤其临床上使用的双歧杆菌、乳酸杆菌这类益生菌，本身就是胃肠道菌群的正常组成部分，是与肠道共存的微生物，制成药后通常无明显副作用。益生菌可调节肠道菌群失调。
三、益生菌的注意事项：
虽然益生菌比药物更安全，但也可能存在不良反应。比如部分人服用后会出现腹胀、腹泻，甚至有些体质较弱的患者会出现长时间的皮疹。当然这些现象恰恰表明益生菌是有效的，并且这些症状会逐渐消失。
总之，要正确认识和使用益生菌，了解其是否适合长期服用、作用以及可能出现的不良反应等。