尿路感染反复发作可能与多种因素有关。据统计，约有 20% - 30%的尿路感染患者会出现反复发作的情况。
病原体未彻底清除
细菌耐药： 如果引起尿路感染的细菌对所用抗菌药物产生耐药性，就难以有效杀灭细菌，从而导致感染反复。比如大肠埃希菌可能对某些常见抗生素逐渐产生耐药性，使得感染持续存在。病原体隐藏： 一些病原体可能隐藏在泌尿系统的特殊部位，如肾盂肾盏的凹陷处等，常规的抗菌药物难以到达这些部位将其彻底清除，当身体抵抗力下降时，就容易引发感染复发。
尿路结构或功能异常
尿路梗阻： 像尿路结石、前列腺增生等情况会引起尿路梗阻，尿液排出不畅，细菌容易在局部滋生繁殖，而且难以被冲洗排出，进而导致尿路感染反复。例如尿路结石患者，结石阻碍尿液流动，感染就容易反复发作。膀胱输尿管反流： 婴幼儿膀胱输尿管反流较为常见，尿液从膀胱反流至输尿管甚至肾盂，使得细菌容易在肾脏等部位定植，增加了尿路感染反复发作的风险。
机体免疫力低下
基础疾病影响： 患有糖尿病等基础疾病的人群，由于机体免疫力受到影响，对细菌的抵抗力下降，容易反复发生尿路感染。比如糖尿病患者血糖控制不佳时，白细胞的杀菌功能会受到影响，更容易让细菌感染持续或复发。长期使用免疫抑制剂： 一些接受器官移植等治疗的患者需要长期使用免疫抑制剂，这会抑制机体的免疫功能，使得身体抵御细菌感染的能力减弱，从而导致尿路感染反复出现。
个人生活习惯不佳
饮水过少： 日常饮水不足会导致尿液生成减少，尿液对尿路的冲刷作用减弱，细菌容易在尿路停留繁殖，增加尿路感染复发的几率。一般建议每天饮水量应保持在1500 - 2000毫升以上。不注意会阴清洁： 不经常清洗会阴部位，会使细菌容易滋生，尤其是女性，会阴部位接近尿道，不注意清洁很容易让细菌侵入尿道引发感染，并且反复发生。