手足口病主要是由肠道病毒引起的，其中以柯萨奇病毒A16型和肠道病毒71型最为常见。超过80%的手足口病病例是由这些肠道病毒感染引发的。
肠道病毒的传播途径
通过密切接触传播： 比如接触了被病毒污染的手、毛巾、玩具、餐具等物品。比如孩子在幼儿园里，如果有小朋友感染了肠道病毒，用了某个玩具后，其他孩子再去玩这个玩具，就有可能被传染。通过飞沫传播： 患者打喷嚏、咳嗽时产生的飞沫中带有病毒，周围人吸入后可能被感染。比如在一个密闭的小空间里，有手足口病患者，他呼出的飞沫会让附近的人有被传染的风险。
易感人群特点
婴幼儿和儿童： 尤其是5岁以下的儿童更容易感染手足口病。因为他们的免疫系统还没有完全发育成熟，对肠道病毒的抵抗力相对较弱。比如在托幼机构中，经常能看到很多3岁左右的孩子患上手足口病。免疫力低下人群： 本身免疫力比较低的人，像患有某些基础疾病、长期使用免疫抑制剂的人，也更容易被肠道病毒侵袭而患上手足口病。
流行季节与环境因素
流行季节： 手足口病多发生在夏秋季节，一般5 - 7月是高发期。这是因为在这个时期，气温和湿度等环境条件比较适合肠道病毒的存活和传播。比如南方的夏季，天气炎热潮湿，肠道病毒更容易在环境中传播。环境因素影响： 卫生条件差的地方，肠道病毒更容易传播。比如一些卫生设施不完善、人群密集又不注意卫生的场所，手足口病的发病风险会更高。比如农村地区如果卫生条件相对较差，孩子感染手足口病的几率可能比城市里卫生条件好的地方要高一些。