手足口病主要是由肠道病毒引起的，其中以柯萨奇病毒A16型和肠道病毒71型最为常见。超过80%的手足口病病例是由这些肠道病毒感染引发的。
病毒的传播途径
通过消化道传播： 病毒可随着被污染的食物、水进入人体。比如，饮用了被肠道病毒污染的水源，就有可能感染手足口病。通过呼吸道传播： 患者咳嗽、打喷嚏时产生的飞沫中含有病毒，健康人吸入这些飞沫后就可能被感染。接触传播： 直接接触患者的粪便、疱疹液或使用过的物品，如玩具、餐具等，也会被病毒侵袭。比如，儿童在幼儿园共用玩具，如果有患病儿童的病毒残留在玩具上，其他儿童接触后就易感染。
易感人群特点
儿童是高发群体： 尤其是5岁以下儿童更容易得手足口病。因为他们的免疫系统还不完善，对肠道病毒的抵抗力较弱。据统计，约90%的手足口病患者年龄在1 - 5岁之间。免疫力低下者： 像本身患有免疫缺陷疾病的儿童或成人，由于自身抵御病毒的能力差，比普通人更易感染手足口病。
流行季节与环境因素
流行季节： 手足口病多发于夏秋季，一般5 - 7月是高发期。这是因为夏季气温较高，适合肠道病毒存活和传播。环境卫生不佳： 居住环境拥挤、卫生条件差的地方，更容易造成肠道病毒的传播。比如，一些城中村的居住环境杂乱，卫生设施不完善，就为手足口病的传播提供了便利条件。