食管反流的症状表现多样，常见的有烧心，约有50%~70%的患者会出现，通常是胸骨后或剑突下有烧灼感，常从胸骨下段向上延伸。还有反酸，约有60%~70%的患者会有，是指胃内容物在无恶心和不用力的情况下涌入咽部或口腔的感觉，多在餐后1小时出现。
典型消化道症状
烧心表现： 多在餐后1小时左右出现，尤其是进食较多油腻、辛辣食物后更容易发生。比如吃了一顿油腻的大餐后，1小时左右胸骨后就会有明显的灼热感。反酸表现： 有时在平卧、弯腰或腹压增高时容易诱发，反流物多呈酸性，感觉口腔里有酸酸的味道。
非典型消化道症状
胸痛表现： 疼痛可放射到心前区、后背、肩部等部位，容易被误以为是心绞痛。一般疼痛程度不一，有的较轻，有的较剧烈，发作时做心电图检查可能无明显心肌缺血表现。吞咽困难表现： 有的患者会出现吞咽困难，初期可能是间歇性发作，当食管瘢痕形成狭窄时，可呈持续性吞咽困难。
食管外症状
咳嗽表现： 反流物刺激咽喉部或气管，可引起咳嗽，尤其是夜间咳嗽较为明显，有的患者会被当作支气管炎来治疗，但按支气管炎治疗效果不佳。据统计，约有10%~30%的反流患者会以咳嗽为唯一表现。哮喘表现： 反流物可能会诱发哮喘发作，这类哮喘往往比较顽固，常规的哮喘治疗药物效果可能不太理想。部分患者在控制反流后，哮喘症状会有所缓解。咽喉炎表现： 长期反流可导致咽喉部不适，出现咽部异物感、声音嘶哑等症状，患者可能会反复看耳鼻喉科，却难以根治。