梅毒晚期会出现多种表现，通常在感染梅毒后数年甚至数十年才会显现。
皮肤黏膜损害表现
结节性梅毒疹： 一般为直径0.3~1cm的结节，数目不等，常呈簇集状、环状或蛇行状排列，好发于头面部、肩部、背部及四肢伸侧。结节质地较硬，无疼痛或轻度压痛，可自然吸收遗留萎缩性瘢痕。树胶肿： 是梅毒晚期较常见的表现，初起为皮下小硬结，逐渐增大，中央软化破溃，形成穿凿性溃疡，边缘锐利，基底有暗红色黏稠分泌物，形似树胶，好发于小腿，也可发生于其他部位，如口腔、上颚等，溃疡愈合后可形成瘢痕。
骨梅毒表现
骨膜炎： 较为常见，多发生于长骨，表现为局部疼痛，夜间加重，疼痛程度不一，可伴有骨膜增厚。骨髓炎： 较少见，可出现骨骼疼痛、肿胀，活动受限，严重时可导致骨骼破坏、畸形。
心血管梅毒表现
主动脉炎： 可累及主动脉根部，引起主动脉扩张，患者可无明显症状，或有胸痛、心悸等表现。主动脉瓣关闭不全： 是心血管梅毒的重要表现之一，可出现心悸、气促、乏力等症状，严重时可导致心力衰竭。主动脉瘤： 多发生于升主动脉，可压迫周围组织引起相应症状，如胸痛、呼吸困难等，动脉瘤破裂可危及生命。
神经梅毒表现
无症状神经梅毒： 脑脊液检查异常，但无任何神经系统症状和体征。脑膜血管梅毒： 可出现头痛、呕吐、颈项强直等脑膜炎表现，以及偏瘫、失语等脑血管意外症状。麻痹性痴呆： 表现为进行性痴呆，伴有人格改变、认知障碍、癫痫发作等。脊髓痨： 主要表现为闪电样疼痛、感觉性共济失调、尿失禁等。