梅毒晚期主要是指三期梅毒，一般在感染梅毒螺旋体后10~30年出现。三期梅毒可累及全身组织和器官，表现多样。
皮肤黏膜损害表现
结节性梅毒疹： 好发于头面部、肩部、背部及四肢伸侧。损害为直径0.3~1cm左右的结节，质地硬，呈铜红色，表面可有鳞屑，常簇集排列，可自然吸收遗留萎缩性瘢痕，也可新疹不断出现，新旧皮疹交替存在。树胶肿： 是三期梅毒的典型表现，初为皮下小硬结，逐渐增大，与皮肤粘连成浸润性斑块，中心逐渐软化破溃，形成穿凿性溃疡，边缘锐利，基底有暗红色肉芽组织，分泌黏稠脓汁似树胶状，可单个或多个发生，好发于头面部、小腿等处，愈合后遗留瘢痕。
骨梅毒表现
骨膜炎： 较为常见，多发生于长骨，表现为局部疼痛，夜间加重，运动后加剧。骨树胶肿： 少见，常发生于扁骨，如颅骨，可形成死骨及皮肤溃疡。
心血管梅毒表现
梅毒性主动脉炎： 可累及主动脉升部、弓部及降部，患者可出现胸痛，疼痛可放射至颈部、肩部等，听诊可闻及主动脉瓣区收缩期杂音。梅毒性主动脉瓣关闭不全： 是心血管梅毒的重要表现，患者可出现心悸、气促等心力衰竭表现，心脏检查可发现主动脉瓣区舒张期杂音等。梅毒性主动脉瘤： 多发生于升主动脉、主动脉弓或降主动脉，瘤体可压迫周围组织引起相应症状，如压迫气管可致呼吸困难，压迫食管可致吞咽困难等。
神经梅毒表现
无症状神经梅毒： 无明显临床症状，但脑脊液检查有异常。脑膜血管梅毒： 可出现头痛、呕吐、偏瘫、失语等神经系统症状。脊髓痨： 主要表现为下肢闪电样疼痛、感觉异常、共济失调、尿失禁等，膝反射和踝反射消失，阿 - 罗瞳孔（瞳孔对光反射消失，调节反射存在）是其特征性表现之一。麻痹性痴呆： 患者出现精神症状，如人格改变、记忆力减退、智能减退等，还可伴有癫痫发作、偏瘫等神经系统体征。