新生儿呕吐的原因较多，常见的有生理性因素和病理性因素等。一般来说，新生儿出生后的1-2个月内，生理性呕吐较为常见，约有40%左右的新生儿会出现生理性呕吐情况。
一、生理性原因
喂养不当引起： 新生儿胃容量小，且呈水平位，若喂奶过多、过快，或喂奶时吞入大量空气，就容易引发呕吐。比如一次喂奶量超过新生儿胃容量的1/2 - 2/3时，呕吐的概率就会增加。喂奶后频繁翻动新生儿，也可能导致呕吐。贲门松弛导致： 新生儿的贲门括约肌发育不完善，比较松弛，而幽门括约肌相对紧张，这样就容易出现胃内容物反流引起呕吐，多见于出生后前3个月内的新生儿。
二、消化系统疾病相关原因
先天性消化道畸形： 如食管闭锁，患儿出生后即出现唾液增多、频繁呕吐、呛咳等症状，且呕吐物中常含有泡沫状液体；先天性十二指肠梗阻，多在出生后24 - 48小时内出现呕吐，呕吐物为胆汁样液体；先天性肥厚性幽门狭窄，通常在出生后2 - 4周开始出现呕吐，呕吐呈进行性加重，呕吐物为奶液和奶凝块，不含胆汁，可在腹部摸到橄榄样肿块。消化不良： 新生儿消化功能尚不成熟，若喂养不规律，或母亲饮食不当通过乳汁影响新生儿，都可能引起消化不良导致呕吐。比如母亲进食过多油腻食物后，母乳喂养的新生儿可能出现呕吐、大便异常等情况。
三、感染性原因
胃肠道感染： 新生儿免疫功能低下，容易受到细菌、病毒等感染引发胃肠道炎症。如细菌感染引起的肠炎，除了呕吐外，还常伴有腹泻、发热等症状；病毒感染引起的轮状病毒性肠炎，呕吐常为首发症状，随后出现腹泻，大便呈蛋花汤样。全身性感染： 新生儿感染肺炎、败血症等全身性疾病时，也可能出现呕吐症状，这是因为感染影响了胃肠道的功能，如肺炎时新生儿呼吸不畅，可能会在吃奶后出现呕吐情况。