脑梗塞的治疗药物需根据病情阶段等选择，一般超早期（发病4.5小时内）符合条件的可使用阿替普酶等溶栓药物，但这类药物有严格的适用和禁忌情况。而在脑梗塞二级预防等情况中，常用的药物有抗血小板聚集药物，像阿司匹林，它能抑制血小板的聚集，降低血栓形成的风险，一般建议长期服用，但有胃肠道出血等病史的人使用需谨慎；还有氯吡格雷，对于不能耐受阿司匹林的患者可以考虑使用。
抗血小板聚集药物
阿司匹林： 通过抑制环氧化酶，减少血栓素A2生成，从而抑制血小板聚集。一般建议长期服用来预防脑梗塞复发，但有胃溃疡、胃肠道出血病史的患者使用时要格外小心，可能会加重胃肠道不适。氯吡格雷： 作用机制是选择性地抑制二磷酸腺苷（ADP）与血小板受体的结合及继发的ADP介导的糖蛋白GPⅡb/Ⅲa复合物的活化，从而抑制血小板聚集。对于不能耐受阿司匹林的患者，可在医生评估后使用，但可能会有出血等不良反应风险。
抗凝药物
华法林： 是一种香豆素类抗凝剂，通过抑制维生素K依赖的凝血因子合成发挥抗凝作用。使用时需要定期监测国际标准化比值（INR），将其控制在合适范围，而且饮食中维生素K摄入的波动可能会影响药效，比如大量进食富含维生素K的绿色蔬菜等。新型口服抗凝药： 像达比加群酯等，相对华法林来说，药物相互作用较少，一般不需要频繁监测INR，但价格相对较高，而且也有出血等风险需要关注。
神经保护类药物
依达拉奉： 是一种自由基清除剂，能抑制脂质过氧化，从而抑制脑细胞、血管内皮细胞、神经细胞的氧化损伤。可用于改善急性脑梗塞患者的神经功能缺损症状，一般通过静脉滴注给药，在使用过程中要注意监测肾功能等指标。胞磷胆碱钠： 可以改善脑代谢，促进大脑功能恢复，通过增加脑血流而促进脑物质代谢，改善脑循环。适用于脑梗塞等神经系统疾病的治疗，一般耐受性较好，但也可能会有胃肠道不适等不良反应。