夜间肛门瘙痒可能由多种原因引起。比如，肠道寄生虫感染是常见原因之一，像蛲虫感染就较为多见，尤其在儿童群体中发生率相对较高。
肠道寄生虫感染导致
蛲虫感染： 蛲虫通常在夜间会爬到肛门周围产卵，从而引起剧烈瘙痒。儿童感染蛲虫的概率相对较高，因为儿童的卫生习惯相对较差，且喜欢用手接触肛门周围再接触其他物品，容易造成自身重复感染。蛔虫等其他寄生虫： 蛔虫等肠道寄生虫也可能引发肛门瘙痒，但相对蛲虫来说，夜间肛门瘙痒因蛲虫导致的情况更为典型。
局部皮肤病变所致
肛周湿疹： 肛周皮肤长期处于潮湿环境，比如出汗较多、不注意肛周清洁等，容易引发湿疹，出现夜间肛门瘙痒的症状。患者肛周皮肤会有红斑、丘疹、水疱等表现，搔抓后可能会破溃、渗出。肛周真菌感染： 当肛周皮肤受到真菌感染时，也会导致瘙痒，尤其在夜间可能感觉更为明显。常见的真菌如念珠菌等，会在肛周皮肤滋生，引起炎症反应。
全身性疾病影响
糖尿病： 糖尿病患者由于血糖升高，皮肤含糖量增加，有利于霉菌生长繁殖，容易发生肛周皮肤真菌感染，从而出现夜间肛门瘙痒的情况。而且糖尿病患者机体抵抗力较低，也更容易受到各种病原体的侵袭。肝胆疾病： 患有肝胆疾病的人，如肝硬化等，由于胆汁淤积，血液中胆盐含量升高，会刺激神经末梢，导致皮肤瘙痒，肛门周围皮肤也可能受累，出现夜间瘙痒症状。