紧急避孕药可能会带来一些伤害，比如约10% - 20%的人服用后会出现月经紊乱，表现为月经提前或推迟。
对月经的影响
月经提前： 服用紧急避孕药后，体内激素水平骤变，可能打乱正常的月经周期，导致月经提前到来，提前时间可能在3 - 7天左右。月经推迟： 也有部分人会出现月经推迟的情况，如果推迟超过1周，就需要警惕是否怀孕或者药物影响了内分泌。
对肠胃的刺激
恶心呕吐： 约有5% - 10%的人服用紧急避孕药后会出现恶心症状，大约1 - 2个小时后可能会伴随呕吐，尤其是空腹服药时更容易发生。肠胃不适： 还可能引起肠胃不适，出现腹痛、腹胀等症状，一般持续时间较短，可能1 - 2天就会缓解，但也有少数人会持续较长时间。
对身体其他方面的影响
头晕乏力： 大概有3% - 5%的人服用后会出现头晕、乏力的情况，这种症状一般比较轻微，持续时间不长，通常1 - 2天内可自行缓解，但在服药后短时间内不宜进行需要高度集中注意力的活动，比如开车等。乳房胀痛： 少数人会出现乳房胀痛的情况，一般是因为药物影响了体内激素水平，导致乳房出现短暂的胀痛，这种胀痛通常在1 - 2周内会逐渐消失。