睾丸附睾炎的治疗需综合考虑多种因素，一般来说，可通过药物治疗、一般治疗等方式来改善。通常抗生素治疗是关键，比如对于细菌感染引起的睾丸附睾炎，常用的抗生素有头孢类等，一般需要使用1-2周左右来控制感染。
药物治疗选择
抗生素应用： 如果是细菌感染导致的睾丸附睾炎，医生会根据病情选用合适的抗生素。像头孢克肟等头孢类抗生素，能抑制细菌细胞壁合成，从而杀灭细菌。如果是衣原体、支原体感染引起的，可能会用到阿奇霉素等药物，它可以阻碍细菌蛋白质合成来发挥作用。非甾体抗炎药： 对于疼痛明显的患者，可使用非甾体抗炎药，如布洛芬。它能通过抑制环氧化酶的活性，减少前列腺素合成，起到抗炎、镇痛的效果，一般能在一定程度上缓解睾丸附睾炎带来的疼痛不适。
一般治疗方法
休息与抬高阴囊： 患者要注意多休息，避免长时间站立或行走。同时可以将阴囊抬高，比如用毛巾或软枕把阴囊垫起来，这样有助于促进血液回流，减轻肿胀疼痛。一般建议休息1-2周左右，让身体有足够时间恢复。局部冷敷或热敷： 在发病初期，可进行局部冷敷，每次冷敷15-20分钟，每天3-4次，能起到减轻水肿、缓解疼痛的作用。而在病情稳定后，可改为热敷，促进血液循环，帮助炎症吸收，但要注意温度不宜过高，避免烫伤皮肤。
手术治疗情况
脓肿形成时： 如果睾丸附睾炎患者出现脓肿，经药物治疗效果不佳，可能需要进行手术引流。一般在超声引导下进行穿刺引流或者切开引流，手术时间通常较短，术后需要注意伤口护理，避免感染，一般恢复需要几周时间。反复发作者： 对于那些反复发生睾丸附睾炎的患者，如果存在附睾梗阻等情况，可能需要考虑手术治疗，如附睾切除术等，但手术是在药物等保守治疗无效后才会考虑。