溃疡性结肠炎的治疗药物需根据病情程度等选择，氨基水杨酸制剂是常用的基础用药，比如柳氮磺吡啶，一般需要持续服用数周甚至数月来控制炎症。
氨基水杨酸制剂类药物
5-氨基水杨酸制剂： 这类药物能抑制炎症介质的产生，减轻肠道炎症。像美沙拉嗪，有口服剂型也有栓剂、灌肠剂等局部剂型。口服美沙拉嗪一般需要连续服用数周，局部剂型则根据病变部位选择使用。柳氮磺吡啶： 是比较传统的氨基水杨酸制剂，通过在肠道分解出5-氨基水杨酸发挥作用，但部分患者可能会出现过敏等不良反应，用药时需密切观察。
糖皮质激素
泼尼松： 属于全身性应用的糖皮质激素，对于中重度溃疡性结肠炎急性发作有较好的抗炎作用。通常起始剂量有一定范围，比如成人一般开始时每日服用30~60毫克，之后根据病情逐渐调整剂量。但长期使用可能会有较多副作用，如骨质疏松、感染风险增加等。氢化可的松： 也可用于溃疡性结肠炎的治疗，一般通过静脉给药，适用于病情较重、口服药物效果不佳的患者。不过静脉使用时要注意监测血压、血糖等指标。
免疫抑制剂
硫唑嘌呤： 适用于对氨基水杨酸制剂疗效不佳或激素依赖的患者。一般需要服用数月才会逐渐起效，用药期间需要定期监测血常规、肝功能等指标，因为可能会引起骨髓抑制、肝损伤等不良反应。巯嘌呤： 作用机制与硫唑嘌呤类似，也用于溃疡性结肠炎的维持治疗等情况。同样需要关注血液系统和肝功能的变化，用药过程中要遵循医生的安排进行定期检查。
生物制剂
英夫利西单抗： 对于重度难治性溃疡性结肠炎有一定疗效。通常需要按照一定的给药方案静脉输注，比如起始剂量后在不同时间点再次给药。但使用生物制剂前需要评估患者的感染等情况，因为可能会增加感染的风险，并且费用相对较高。