直肠息肉的治疗方法需根据息肉的类型、大小、数量等因素来定。一般来说，较小的良性息肉可通过内镜下切除等方式处理，而较大或有恶变倾向的可能需要外科手术。
内镜下切除治疗
内镜下圈套切除术：对于直径小于2厘米的有蒂息肉，可通过内镜将圈套器套住息肉根部，然后电灼切除，这种方法创伤小，恢复快。内镜下黏膜切除术（EMR）：适用于较大的无蒂息肉，将黏膜下注射后用圈套器切除息肉，能完整切除病变组织。
外科手术治疗
开腹手术：当息肉较大、位置特殊或怀疑有恶变且内镜下无法完整切除时，可能需要开腹手术切除息肉及部分肠管。一般这种情况相对较少见，多是息肉情况较复杂时采用。腹腔镜手术：这是一种微创手术方式，通过腹部几个小切口插入腹腔镜和手术器械进行息肉切除，相比开腹手术，具有创伤小、恢复快等优点，适用于合适的直肠息肉患者。
随访观察情况
小的良性息肉：如果是很小的、病理检查确定为良性的息肉，且数量少，医生可能会建议定期随访观察，一般3 - 6个月做一次肠镜检查，观察息肉是否有变化。比如直径小于1厘米的炎性息肉，在没有明显症状且初步判断为良性时，可以先随访。术后复查：无论是内镜下切除还是外科手术切除息肉后，都需要定期复查肠镜，一般术后1年需要做首次复查，以确保息肉没有复发等情况。