直肠息肉的治疗方式需根据息肉的类型、大小、数量等因素来定。一般来说，较小的良性息肉可通过内镜下切除等方法处理，较大或有恶变倾向的可能需要手术切除。
内镜下切除治疗
小息肉内镜切除：对于直径小于2厘米的良性直肠息肉，常可在内镜下进行切除。比如直径在0.5~1厘米左右的息肉，通过内镜下的圈套器切除等方式较为常见，这种方法创伤小，患者恢复相对较快。内镜黏膜下剥离术（ESD）：如果息肉较大但局限于黏膜层，直径在2~10厘米左右的息肉，可采用ESD。它能完整切除较大的息肉，不过操作相对复杂些，但能尽量完整去除病变组织。
手术切除治疗
开腹手术：当直肠息肉较大且基底较宽，怀疑有恶变或者内镜下切除困难时，可能需要开腹手术。一般适用于直径大于10厘米或者怀疑有恶性病变的息肉，这种手术创伤较大，术后恢复时间相对较长。腹腔镜手术：这是一种微创手术方式，相对于开腹手术创伤小。对于一些较大的直肠息肉，尤其是位置较深但适合腹腔镜操作的情况，可通过腹腔镜进行切除，术后恢复也比开腹手术快一些，但对医生技术要求较高。
观察随访情况
良性小息肉随访：对于一些非常小的、良性可能性大的息肉，比如直径小于0.5厘米的增生性息肉等，有时可以先进行观察随访。一般建议3~6个月复查一次肠镜，观察息肉的变化情况。如果息肉没有变化或者长大不明显，再决定后续处理；如果息肉有增大等异常情况，再考虑进一步治疗。特定人群随访：比如一些年龄较大、身体状况较差不能耐受手术的患者，对于较小的良性息肉也可以先选择定期随访，但需要密切关注息肉的变化。