肠结核患者常见的症状有腹痛，多位于右下腹，约有1/3的患者会出现这种情况，疼痛性质多为隐痛或钝痛，有时在进餐时会诱发，还可能伴有排便习惯改变，比如腹泻与便秘交替出现。
消化系统症状表现
腹泻： 是肠结核常见症状之一，每日排便数次至十余次不等，粪便多呈糊样，一般不含黏液或脓血，严重时腹泻次数会更多。便秘： 部分患者会出现便秘情况，粪便干结如羊粪状，与腹泻交替出现是肠结核比较典型的肠道功能紊乱表现。
全身症状表现
发热： 多数患者有午后低热，体温一般在37.5℃~38℃之间，也有部分患者会出现弛张热或稽留热。伴有继发感染时，可能会有高热表现。盗汗： 患者常于夜间或睡醒时出现盗汗现象，严重的患者衣物会被汗液湿透。消瘦、乏力： 由于结核分枝杆菌的毒素作用以及肠道吸收功能障碍，患者会逐渐出现消瘦、乏力等全身消耗表现，体重可能会明显下降。
腹部体征表现
腹部压痛： 右下腹常有固定的轻压痛，压痛点比较局限。腹部肿块： 约1/3的患者可触及腹部肿块，多位于右下腹，肿块质地中等，比较固定，伴有轻度或中度压痛。肿块形成的原因可能是病变肠段和周围组织粘连，或肠系膜淋巴结结核。肠鸣音亢进： 部分患者会出现肠鸣音亢进的情况，这是因为肠道受到刺激后蠕动增强所致，但这种表现并不是所有肠结核患者都会出现。