多囊卵巢综合征的病因目前尚未完全明确，一般认为是遗传与环境因素共同作用所致。有研究显示，约60%~70%的患者存在遗传易感性。
遗传因素方面
家族遗传倾向：多囊卵巢综合征具有一定的家族聚集性，如果母亲患有多囊卵巢综合征，其女儿患该病的风险比正常人群高出很多。比如有家族史的女性，发病概率比无家族史者高2~3倍。基因遗传特点：目前发现多个与多囊卵巢综合征相关的基因位点，这些基因可能影响内分泌调节、胰岛素代谢等过程，从而增加患病风险。
内分泌失调方面
下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴调节异常：下丘脑分泌的促性腺激素释放激素（GnRH）脉冲频率异常，会导致垂体分泌的促黄体生成素（LH）升高，促卵泡生成素（FSH）相对降低，LH/FSH比值通常大于2~3。这种失衡会影响卵巢的正常排卵功能，使得卵巢不能正常排出卵子，进而引发一系列症状。胰岛素抵抗与高胰岛素血症：约50%~70%的多囊卵巢综合征患者存在胰岛素抵抗，即身体对胰岛素的敏感性降低。为了维持正常的血糖水平，胰腺会分泌更多胰岛素，导致高胰岛素血症。高胰岛素血症会刺激卵巢分泌过多雄激素，进一步干扰排卵，加重病情。
生活方式因素方面
饮食不规律：长期高热量、高脂肪、高糖的饮食，会使身体脂肪堆积，尤其是腹部脂肪堆积，容易引发胰岛素抵抗，从而增加多囊卵巢综合征的发病风险。例如，每天摄入过多油炸食品、甜食等，就可能影响内分泌平衡。缺乏运动：运动量过少会导致身体代谢减慢，脂肪更容易堆积，也会影响胰岛素的敏感性，增加患病几率。研究表明，每周运动时间少于1小时的人群，患多囊卵巢综合征的风险比运动较多的人群高约20%。长期精神压力大：长期处于高压力状态下，会影响下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴的调节功能，导致激素分泌紊乱，增加患病可能性。比如长期面临工作、学习等多方面压力的女性，发病风险相对较高。