药物流产后判断是否流干净的方式包括流血量、下腹是否疼痛以及做B超检查。
一、流血量：通常药物流产后阴道流血一般会持续3至7天，流血量会逐渐减少且颜色逐渐变淡。要是出现流血不止的情况，很可能是没有流干净。这是因为如果流产不完全，子宫内有残留组织，就会持续刺激子宫收缩，导致出血时间延长且出血量较多。
二、下腹是否疼痛：一般药物流产后下腹疼痛会持续3至7天，并且疼痛强度也会逐渐减弱。但如果下腹疼痛持续且较为强烈，大多是引发了炎症或者有残留。因为有残留组织存在时，会不断刺激子宫，引起较为剧烈的疼痛。此时就应该及时前往医院进行检查。
三、做B超检查：一般是在药物流产后的两周或一个月内进行B超检查。如果宫腔内未发现残留，或者仅有少量宫腔积液，那就表明药流干净了。反之，则说明有残留。B超可以清晰地显示子宫内的情况，准确判断是否有残留组织。
总之，通过观察流血量、下腹疼痛情况以及进行B超检查等方法，可以较为准确地判断药物流产后是否流干净，以便及时采取相应措施。