宝宝高烧39度，可通过使用退烧药物、物理降温、日常调理以及必要时的就诊治疗等方式来处理，具体如下：
一、使用退烧药物：
1.宝宝高烧39度时，为避免高热惊厥或其他并发症，需尽快给予退烧药物治疗。
2.一般可在医生指导下给宝宝服用乙酰氨基酚、布洛芬等退烧药物进行降温。
二、物理降温：
1.物理降温的方法包含使用退烧贴，其主要是利用透皮吸收原理，表面的凝胶通过水分汽化能带走皮肤表面热量，从而起到退烧作用。
2.还可采用温水擦浴，即用温热毛巾擦拭宝宝颈部、腋窝等大血管经过处，降低血液温度，起到辅助降温效果，同时缓解高烧带来的身体不适感。
三、日常调理：
1.近期家长要注意给宝宝做好保暖工作，防止其受凉。
2.让宝宝多休息，减少运动。
3.饮食要以营养清淡为主，适当补充维生素C，以增强机体抵抗力。
四、就诊治疗：
1.由于宝宝体质相对较弱，特别是婴幼儿，高热容易使大脑皮质过于兴奋或抑制，从而引发高热惊厥。
2.有些宝宝的高热还可能是由脑炎、脑膜炎、肺炎等疾病导致，所以在家长对宝宝进行药物和物理降温处理后，如果症状仍无好转，应尽快带其就诊，以防病症加重。
总结：宝宝高烧39度时，需综合运用退烧药物、物理降温、日常调理等方法来应对，若情况未改善则要及时就诊治疗。