肠易激综合症的治疗药物需根据不同症状选择，一般来说，缓解腹痛可使用匹维溴铵，它是一种选择性作用于胃肠道平滑肌的钙通道阻滞剂，能有效缓解肠道痉挛引起的腹痛，通常没有严重的全身性副作用，但对孕妇和哺乳期妇女的安全性尚未完全确定，应慎用。
一、缓解腹痛类药物
匹维溴铵： 选择性作用于胃肠道平滑肌，通过阻滞钙离子流入肠道平滑肌细胞，发挥抗痉挛作用，可缓解肠易激综合症引起的腹痛症状，一般耐受性良好，少数人可能会出现轻微的胃肠不适、嗜睡或眩晕等，但发生率较低。曲美布汀： 能调节胃肠运动节律，对胃肠道运动功能紊乱有改善作用，可用于肠易激综合症导致的腹痛、腹胀等症状的缓解，不良反应较少，偶有口渴、口内麻木、腹泻、便秘和心动过速等。
二、调节肠道菌群类药物
双歧杆菌四联活菌片： 含有双歧杆菌、嗜酸乳杆菌、粪肠球菌和蜡样芽孢杆菌等肠道有益菌，这些有益菌可补充肠道正常菌群，抑制肠道中有害菌的生长繁殖，调整肠道菌群平衡，从而改善肠易激综合症患者的肠道功能，常见不良反应较少，个别人可能会出现便秘情况。枯草杆菌二联活菌颗粒： 包含枯草杆菌和肠球菌，可直接补充正常生理菌丛，抑制致病菌，促进营养物质的消化、吸收，抑制肠源性毒素的产生和吸收，达到调整肠道菌群的目的，适用于肠易激综合症伴有肠道菌群失调的患者，偶见腹泻次数增加，停药后可恢复。
三、缓解腹泻类药物
洛哌丁胺： 是一种强效的外周阿片受体激动剂，能抑制肠道平滑肌的收缩，减少肠蠕动，延长肠内容物的滞留时间，从而发挥止泻作用，可用于控制肠易激综合症的腹泻症状，但需要注意过量使用可能会引起便秘、腹胀等不良反应，儿童使用时需谨慎，2岁以下儿童不建议使用。复方地芬诺酯： 由地芬诺酯和阿托品组成，地芬诺酯对肠道作用类似吗啡，可直接作用于肠平滑肌，通过抑制肠黏膜感受器，消除局部黏膜的蠕动反射而减弱肠蠕动，阿托品则可协同加强地芬诺酯的止泻作用，不过要注意长期大量使用可能会成瘾，且肝病患者和正在服用成瘾性药物者应慎用。