肛门瘙痒可能由多种原因引起。据统计，约有超过半数的肛门瘙痒与局部皮肤病变、寄生虫感染等因素相关。
局部皮肤病变导致
肛周湿疹：这是常见原因之一，多因局部潮湿、过敏等引起。患者肛周皮肤会出现红斑、丘疹、水疱等，搔抓后可渗出、结痂，长期不愈会导致皮肤增厚、粗糙。比如一些长期处于潮湿环境工作的人，就较易患上肛周湿疹引发肛门瘙痒。痔疮：当痔疮发作时，尤其是内痔脱出嵌顿，会导致肛门闭合不全，肠道分泌物易渗出到肛周皮肤，刺激皮肤引起瘙痒。Ⅱ度以上内痔患者出现肛门瘙痒的概率相对较高。
寄生虫感染因素
蛲虫感染：多见于儿童，夜间雌虫会爬出肛门产卵，刺激肛周皮肤，引起剧烈瘙痒，尤其以夜间明显。据相关儿科资料，在儿童肠道寄生虫感染中，蛲虫感染引发肛门瘙痒较为常见。蛔虫等其他寄生虫：虽然相对蛲虫少见，但肠道内蛔虫等寄生虫有时也可能导致肛门瘙痒，不过一般不如蛲虫感染典型。
全身性疾病影响
糖尿病：糖尿病患者血糖控制不佳时，尿液中含糖量升高，会刺激肛周皮肤，或者并发神经病变等，容易出现肛门瘙痒症状。约有10% - 20%的糖尿病患者会出现皮肤瘙痒的并发症，其中包括肛门瘙痒。肝胆疾病：如肝硬化、胆汁淤积症等，由于血液中胆盐含量升高，会沉积在皮肤，刺激神经末梢引起瘙痒，也可能波及肛周皮肤导致肛门瘙痒。一些晚期肝硬化患者常伴有皮肤瘙痒的表现。
不良生活习惯所致
卫生习惯差：不注意肛周清洁，粪便残渣残留刺激皮肤，容易引发瘙痒。建议每天至少用温水清洗肛周1 - 2次。穿着不恰当：穿紧身、不透气的内裤，或者化纤材质的内裤，会使肛周局部温度升高、湿度增大，不利于皮肤呼吸，容易诱发肛门瘙痒。比如长期穿着紧身化纤内裤的人群，肛门瘙痒发生率相对较高。