窦性心律失常是指窦性心律的起源未变，但节律不整，其引起的原因主要有以下几方面。首先是生理因素，比如健康年轻人在情绪激动、剧烈运动后可能出现窦性心律失常，像部分人剧烈运动后心率会有波动，出现窦性心律不齐，这是比较常见的情况。
生理因素相关
睡眠与呼吸影响： 在睡眠状态下，尤其是儿童，窦性心律可能会有一定变化。另外，呼吸也会对窦性心律产生影响，比如吸气时心率可能会增快，呼气时心率稍减慢，这种呼吸性窦性心律不齐在青少年中较为多见，一般属于生理现象，无需特殊处理。
病理因素相关
心脏疾病引发： 一些心脏疾病会导致窦性心律失常，比如冠心病，当冠状动脉发生粥样硬化，心肌供血不足时，可能影响心脏的电活动，从而出现窦性心律失常。还有心肌病，各种原因引起的心肌病变，如扩张型心肌病等，也可能干扰心脏的正常节律，导致窦性心律失常的出现。全身性疾病影响： 某些全身性疾病也会波及心脏，引发窦性心律失常。例如甲状腺功能亢进，患者体内甲状腺激素水平升高，会使机体代谢加快，心脏负担加重，进而影响窦性心律，导致窦性心动过速等窦性心律失常表现。还有发热性疾病，当体温升高时，身体代谢增强，心脏需加快跳动来满足机体需求，可能出现窦性心动过速这种窦性心律失常情况。
药物等因素相关
药物作用导致： 一些药物的使用也可能引起窦性心律失常。比如使用拟交感神经药物，像肾上腺素等，可能会导致窦性心动过速；而使用洋地黄类药物过量时，也可能干扰心脏的电生理活动，引发窦性心律失常。另外，一些抗心律失常药物使用不当，也可能诱发新的窦性心律失常问题。