新生儿40天仍有黄疸，可能是以下原因引起的：
1.胆红素生成过多：
红细胞破坏增加：新生儿出生后，过多的红细胞被破坏，产生大量的胆红素。
血红素加氧酶含量高：新生儿的肝脏内血红素加氧酶含量较高，使胆红素生成增加。
其他：同族免疫性溶血、感染、肠肝循环增加等也可导致胆红素生成过多。
2.肝脏胆红素代谢障碍：
肝细胞摄取胆红素能力差：新生儿的肝细胞内Y、Z蛋白含量不足，摄取胆红素的能力较弱。
肝脏结合胆红素功能差：葡萄糖醛酸转移酶的含量和活性较低，导致肝脏结合胆红素的能力不足。
排泄胆红素功能差：肝内胆管和肝外胆管均较狭窄，容易发生胆汁淤积，影响胆红素的排泄。
3.胆汁排泄障碍：
新生儿肠道内正常菌群尚未建立，胆红素的肝肠循环增加，可导致黄疸持续时间较长。
先天性胆道闭锁：是导致新生儿持续性黄疸的常见原因，需要及时进行手术治疗。
针对新生儿40天仍有黄疸的情况，建议家长及时带孩子就医，医生会根据具体情况进行评估，并采取相应的治疗措施。一般包括以下几种：
1.光照治疗：通过蓝光照射，促进胆红素的分解和排泄。
2.药物治疗：医生可能会开一些药物，如苯巴比妥等，以加速胆红素的代谢。
3.其他治疗：根据具体情况，医生还可能会采取换血治疗、支持治疗等措施。
在治疗过程中，家长需要密切观察孩子的黄疸情况，如有加重或其他异常，应及时告知医生。同时，要注意保持孩子的营养和水分摄入，确保孩子的健康成长。