萎缩性胃炎的治疗药物需根据具体情况选择，一般常用药物有抑酸剂、胃黏膜保护剂等。比如质子泵抑制剂中的奥美拉唑，可抑制胃酸分泌，常用剂量能有效缓解因胃酸过多引起的不适，但具体用药要遵医嘱。
抑酸类药物
质子泵抑制剂： 像奥美拉唑，能抑制胃壁细胞质子泵，减少胃酸分泌，一般可缓解萎缩性胃炎患者因胃酸刺激导致的胃痛、反酸等症状。不过，严重肾功能不全者要慎用这类药物。H₂受体拮抗剂： 例如雷尼替丁，通过阻断组胺H₂受体来抑制胃酸分泌，对缓解萎缩性胃炎相关的胃酸症状有一定作用，但孕妇及哺乳期妇女使用时需咨询医生。
胃黏膜保护剂
铋剂： 常见的枸橼酸铋钾，能在胃黏膜表面形成保护膜，阻挡胃酸、胃蛋白酶等对胃黏膜的侵袭，促进黏膜修复。不过，肾功能不全者长期服用可能会导致铋剂在体内蓄积，需注意监测肾功能。铝碳酸镁： 它可以中和胃酸，还能吸附胆汁，对保护胃黏膜有帮助，能缓解萎缩性胃炎患者的上腹部不适等症状，但患有低磷血症的患者要避免长期大量服用。
促进胃动力药物
多潘立酮： 能促进胃肠蠕动，改善萎缩性胃炎患者可能出现的消化不良、腹胀等症状。不过，心脏病患者、接受化疗的肿瘤患者等使用时要谨慎，需在医生指导下用药。莫沙必利： 同样是促进胃动力的药物，可增强胃肠道蠕动，帮助食物消化排空，缓解萎缩性胃炎伴随的消化功能问题，但孕妇及哺乳期妇女使用前要咨询医生。